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对于不同的分选柱，铁珠之间的空间在250-500μm，是白细胞直径的10倍以上，细胞可以自由流穿，不会有挤压或黏着。分选柱填充有不同规格的铁珠，将磁场放大10000倍，因此只需要非常少量且“小身材”的磁珠标记，即可有效分选细胞。无柱式分选磁场极度低，只能通过大量磁珠或是微米级的“大块头”磁珠标记来弥补。

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